La Société de l’École des chartes a la possibilité d’attribuer des prix et des subventions. Les prix sont au nombre de trois :
Par ailleurs, la Société de l’École des chartes peut attribuer des subventions pures et simples, non assorties de prix.
Le prix Lenoir et les subventions ne peuvent être attribués qu’à des archivistes paléographes membres de la Société de l’École des chartes. Pour faire acte de candidature, il faut adresser au président de la Société ou à un autre membre du Bureau le manuscrit de l’ouvrage prêt pour l’impression, accompagné d’un devis d’édition.
Ces aides à la publication sont accordées par une commission ad hoc constituée au sein du conseil d’administration de la Société et qui se réunit en principe trois fois par an.
Le prix Madeleine Lenoir a été attribué en 2010 à David Feutry pour sa thèse d'École des chartes intitulée Un
magistrat entre service du roi et stratégies familiales : Guillaume
François Joly de Fleury (1675-1756).
Et, en 2011, à Pierre-Marie Berthe pour sa thèse sur Les procureurs français à la cour pontificale d’Avignon (1309 – 1376).
Le prix Auguste Molinier a été attribué en 2010 à Romain Le Gendre et en 2011 à Elsa Gabaude et Rémi Gaillard pour leurs travaux portant respectivement sur L’usure en procès. Le gouvernement économique de l’Eglise au temps des papes d’Avignon et « Après qu’il s’est assemblé marchands fripiers, tapissiers, revendeurs et autres citoyens… ». Etude institutionnelle des ventes révolutionnaires du mobilier royal. Versailles, Marly, Saint-Cloud, Bellevue (1793 – 1795).
La Société a, d’autre part, subventionné la publication des travaux de Justine Berlière sur Policer Paris au Siècle des Lumières. Les commissaires du quartier du Louvre dans la seconde moitié du XVIII° siècle et ceux d’Anne Mary portant sur Drame et pensée : le cas Gabriel Marcel.